I trattamenti meccanici a cui vengono sottoposti i fanghi fanghi biologici hanno il compito di separarli dal resto del refluo chiarificato o trattato.
Infatti, dopo un tempo opportuno di permanenza nella vasca di ossidazione, i fanghi biologici o attivi passano al sedimentatore secondario dove, sedimentando, si separano dal refluo trattato o chiarificato.